Бергоми начал свою тренерскую карьеру в 2008 году, когда вместе с молодежно-любительской командой Интера завоевал главный трофей турнира. Затем в течение двух лет тренирует молодежные команды Монцы.
Летом 2011 года получает приглашение от Аталанты на пост главного тренера Beretti. В первом же сезоне выводит свою команду в финал Чемпионата, где в упорной борьбе проигрывает Beretti Интера (которую тренирует Серджио Дзанетти, брат Хавьера прим. ред.) со счетом 3-4. Но Беппе Бергоми не был бы самим собой, если бы не взял реванш! Уже на следующий сезон он и его команда празднуют победу на турнире, где в финале был повержен Интер с общим счетом 4-2.
"Мне очень нравится работать с молодежью. Хочу выразить свою благодарность руководству клуба Комо, которые доверили мне столь ответственную работу", - цитирует слова Беппе CalcioComo1907.it.
